Trường Đại học Tôn Đức Thắng có các chương trình đại học: 52 ngành đại học tiêu chuẩn, 20 ngành đại học tiên tiến, 11 ngành đại học bằng tiếng Anh, 14 ngành liên kết quốc tế.
Nhóm ngành Kỹ thuật - Công nghệ
Nhóm ngành Khoa học ứng dụng
Nhóm ngành Khoa học xã hội - Nhân văn Mỹ thuật
Nhóm ngành kinh tế